Cloud self-service
La plateforme Cloud self-service
La plateforme Cloud self-service de l’Inserm propose des services Cloud sur étagère, accessibles en autonomie, pour l’hébergement, le calcul haute performance, le stockage et le traitement des données. Certaines configurations sont certifiées Hébergeurs des Données de Santé (HDS).
Aucun transfert de données de santé à caractère personnel n’est réalisé vers un pays tiers à l’espace économique européen.
Une plateforme Cloud accessible en autonomie
La plateforme Cloud self-service propose des services Cloud accessibles directement par les chercheurs, en autonomie. Elle est organisée autour de trois offres non exclusives et complémentaires.
Protégez et sécurisez vos données avec un hébergement souverain et certifié HDS
Des outils transverses au service des usages et de la donnée
Des chaînes d’intégration et d’orchestration des flux de données ou ETL (Extract Transform Load) avec Apache Airflow
Des outils d’anonymisation et de pseudonymisation
Un accès à des repositories avec Nexus permettant d’accélérer la conception logicielle
Un outil de transfert de données avec Axway, incluant le scan anti-virus et le workflow de sortie de données en HDS
InsermCloud HDS et NHDS
Présentation générale
La plateforme est destinée aux chercheurs et équipes de recherche ayant des besoins récurrents en :
- Hébergement et environnements techniques (machines virtuelles)
- Stockage de données
- Traitement et exploitation des données
- Calcul haute performance (CPU et GPU), notamment pour les usages biomédicaux et IA
- Outillage métier de recherche clinique et d’accélération d’ingénierie logicielle
Elle permet de répondre à des cas d’usage variés, en environnement HDS ou nHDS selon les besoins. Les offres sont non exclusives : une même équipe peut activer plusieurs offres selon son projet.
La plateforme permet également de travailler sans couture, grâce à l’exécution de pipelines de traitement conteneurisés déjà existants avec Apptainer et à la possibilité d’importer ses propres données. Elle est accessible sans VPN, même pour le transfert de la donnée.
Le Cloud self-service : trois offres complémentaires
Offre 1
Outillage pour la recherche clinique (HDS et nHDS)
Cette offre met à disposition un ensemble d’outils dédiés à la recherche clinique, couvrant les principales étapes du cycle de vie de la donnée :
- Collecte de données : REDCap
- Gestion et exploitation des données : entrepôts de données avec Greenplum
L’offre inclut également des jours de support au paramétrage afin d’accompagner les chercheurs dans la mise en œuvre (configuration et prise en main).
Offre 2
Conception, test et calcul HPC (HDS uniquement)
Cette offre s’adresse aux chercheurs ayant des besoins de calcul haute performance. Elle repose sur une infrastructure de calcul mutualisée haute puissance sur GPU ou CPU, accessible via le portail OpenOnDemand, permettant la conception, le test et l’exploitation des calculs dans un cadre HDS. Par exemple, les CPU sont adaptés aux calculs scientifiques classiques, souvent utilisés pour des calculs génomiques, tandis que les GPU sont particulièrement performants pour les traitements intensifs et parallèles, comme l’apprentissage automatique, le deep learning, ou le traitement d’images et de vidéos.
La plateforme met à disposition une suite d’outils pré‑packagés pour les utilisateurs les moins matures, notamment :
- Une liste de BioContainer
- Jupyter, RStudio, code-server
- Accès à des librairies sécurisées
Les calculs peuvent aussi être exécutés en ligne de commande directement depuis une bulle sécurisée.
Offre 3
Infrastructure (HDS et nHDS)
Cette offre fournit un socle d’infrastructure générique consommable en self-service par les chercheurs, en environnement HDS ou nHDS selon les cas :
- Des machines virtuelles « nues » allant jusqu’à 16 CPU et 64 Go de RAM
- Des espaces de stockage, incluant du stockage objet de type S3
La combinaison RAM/CPU des machines virtuelles est modulable et peut être modifiée librement par les chercheurs.
Outils transverses au service des usages et de la donnée
En complément des trois offres, le DSI met à disposition un portefeuille d’outils transverses :
- Chaînes d’intégration et d’orchestration des flux de données / ETL avec Apache Airflow
- Outils d’anonymisation et de pseudonymisation
- Accès à des repositories avec Nexus pour accélérer la conception logicielle
- Outil de transfert de données avec Axway, incluant le scan anti-virus et le workflow de sortie de données en HDS
- Usine logicielle HDS et nHDS
Questions fréquentes
Afin de permettre au plus grand nombre de chercheurs de découvrir et d’utiliser le Cloud self‑service de l’Inserm, les services proposés sur le portail sont mis gratuitement à disposition.
Les éventuels tarifs affichés ont uniquement une vocation informative à ce stade.
Dans un souci d’équité et afin de garantir un niveau de service satisfaisant pour tous, des plafonds de consommation ont été définis par projet : jusqu’à 5 machines virtuelles d’infrastructure, 5 To d’espace de stockage rapide et 1 machine virtuelle de staging HPC. Par ailleurs, la capacité globale de ressources provisionnables reste volontairement limitée, afin d’assurer la robustesse et la disponibilité des services pour l’ensemble des utilisateurs.
Le choix entre HDS et non HDS dépend du type de données manipulées.
Environnement HDS :
- Obligatoire pour les données de santé à caractère personnel
- Hébergement certifié et sécurisé
- Accès aux machines virtuelles via des bulles sécurisées
- Accès restreint à des packages validés
- Processus de téléversement et téléchargement adapté (scan antivirus, validation de sortie de donnée)
Environnement non HDS :
- Pour les données non sensibles ou non réglementées
- Plus de flexibilité d’usage
- Installation libre d’outils et accès Internet ouvert
Il est de votre responsabilité de choisir l’environnement adapté à vos données.
L’accès se fait via le portail des services :
- Choisir l’environnement souhaité et cliquer sur le bouton « Accéder au Cloud … »:
- HDS si votre projet traite des données de santé
- non HDS si non
Un guide de connexion détaillé est disponible dans la rubrique Se documenter.
Disponible pour :
- Toute personne travaillant dans une structure Inserm.
Obtenir de l’aide
- Support opérationnel : Pour toute question technique ou difficulté d’usage, vous pouvez ouvrir un ticket via l’outil de support dédié Matrix 42. Les modalités de traitement et les niveaux de prise en charge sont précisés dans le guide support hébergé dans l’onglet « Se documenter ».
- Temps d’échange et accompagnement : En complément du support formel, des créneaux de questions-réponses sont proposés afin de clarifier un point technique, accompagner une première mise en œuvre ou partager des bonnes pratiques. Ces temps d’échange favorisent une résolution rapide des problématiques et une montée en autonomie des équipes projet.
Se documenter
Les documents seront disponibles très prochainement. Nous vous en informerons dans le bandeau d’actualités de la page d’accueil.
Guides d’utilisation
1.Comprendre la plateforme
Guide je me connecte
2.Maîtriser les offres de services
Offre Infrastructure
Offre HPC
Guide HPC génomique_pdf 2,3Mo
Guide HPC Ollama_pdf 2,2Mo
Guide HPC S3_pdf 2,1Mo
Guide vLLM_10,9Mo
Utilisation de Slurm avec la plateforme HPC Inserm_pdf 1,5Mo
Utilisation de Conda avec la plateforme HPC Inserm_pdf 2,3Mo
Installation de Biocontainers sur la plateforme HPC Inserm_pdf 991ko
Webinaire d’appropriation
En complément des guides, un webinaire sera proposé afin de présenter l’architecture et les offres, illustrer des cas d’usage concrets et répondre aux questions des utilisateurs.
Services associés
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